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Molecular markers as a tool for phylogenetic studies in Proseriata (Platyhelminthes: Neoophora)

Scarpa, Fabio (2014) Molecular markers as a tool for phylogenetic studies in Proseriata (Platyhelminthes: Neoophora). Doctoral Thesis.

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Abstract

The order Proseriata is one of the most abundant groups of the meiofauna, particularly common in high-energy habitats. Studying Proseriata is difficult, as they are very minute animals with few morphological features that can be used for taxonomic analysis. The lack of diagnostic characters hinders the study of Proseriata by means of traditional methods, and molecular analyses are in most cases needed to reconstruct the phylogeny of Proserata and to provide reliable taxonomic assessment. Here, the results of five study cases were reported: i) the new recently discovered species, Pseudomonocelis paupercula was studied by means of an integrative taxonomic approach that include morphology, karyology, molecular phylogeny, reproductive biology and parentage analyses; ii) the Parotoplana tubifera species group was also investigated by an integrative approach that includes morphology, karyology and molecular phylogeny, and four new Parotoplana species were described; iii) phylogenetic relationships within the genus Monocelis, and within the family Monocelididae were investigated, and two new Mediterranean species belonging to the genus Monocelis was retrieved; iv) the first molecular clock for Proseriata was calibrated, that can be an appealing integration to the integrative taxonomic approach, and can provide phylogenetic reconstruction more accurate in future analyses; v) universal primers were designed to obtain a wider molecular sampling in Proseriata, so far very scarce. = L'ordine Proseriata costituisce uno dei più abbondanti gruppi della meiofauna, i cui rappresentanti sono particolarmente comuni in habitat ad alta energia. Gli studi sui Proseriata sono particolarmente problematici, in quanto l'ordine è rappresentato da organismi di ridotte dimensioni con pochi caratteri diagnostici utili ai fini tassomici. Per questo motivo i Proseriata non possono essere studiati solamente con metodi tradizionali e negli ultimi anni ci si è avvalsi di un approccio tassonomico integrato, comprendente analisi molecolari, sia per le ricostruzioni filogenetiche, sia per l'inquadramento tassonomico. Questo elaborato è costituito da cinque linee di ricerca: i) una nuova specie di recente scoperta, Pseudomonocelis paupercula, è stata descritta e analizzata mediante approccio tassonomico integrato; ii) quattro nuove specie appartenenti al gruppo di specie Parotoplana tubifera sono state descritte e sono state studiate le relazioni filogenetiche all'interno del gruppo e della famiglia Otoplanidae; iii) sono state chiarite le relazioni filogenetiche all'interno del genere Monocelis e della famiglia Monocelididae; questo studio ha portato alla scoperta di due nuove specie del genere Monocelis; iv) è stata eseguita la prima calibrazione dell'orologio molecolare nei Proseriati, che consente di implementare l'approccio tassonomico integrato; v) sono stati disegnati primer universali per i Proseriati, al fine di ampliare l'attuale campionamento molecolare sinora esiguo.

Item Type:Doctoral Thesis
ID Code:9505
Contributors:Casu, Marco
Publisher:Università degli studi di Sassari
Uncontrolled Keywords:Proseriata, molecular phylogeny, molecular clock, ribosomal DNA, ISSR Parole chiave: Proseriata; Filogenesi molecolare; Orologio molecolare; DNA ribosomiale; ISSR.
Subjects:Area 05 - Scienze biologiche > BIO/05 Zoologia
Divisions:001 Università di Sassari > 01-a Nuovi Dipartimenti dal 2012 > Scienze della Natura e del Territorio
Cicli, scuole e corsi:Ciclo 26 > Scienze della natura e delle sue risorse > Biologia ambientale
Deposited On:03 Apr 2014 08:32

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